northern印迹杂交简介

Northern印迹杂交是一种RNA检测技术,其基本原理与Southern印迹杂交中的DNA吸印相似。主要区别在于RNA处理步骤,Northern印迹前,使用甲基氢氧化银、乙二醛或甲醛对RNA进行变性,而非NaOH,因为NaOH会破坏RNA的2'-羟基基团。这样处理后的RNA更易于在转印过程中与硝酸纤维素膜结合。通常在高盐条件下进行转印,但为了确保RNA稳定,转印后需用低盐缓冲液清洗,以防RNA被洗脱。


在实验过程中,不能在胶中添加EB,因为它会干扰RNA与膜的结合。为了确定样品中RNA片段的大小,可以同时在胶中加入分子量标记物,通过电泳后,标记物会被切下并上色,然后通过照相记录。而样品胶则进行Northern转印。标记物的上色方法是在暗室中将其浸入含有5μg/ml EB的0.1mol/L醋酸铵溶液中10分钟,然后在紫外光下通过一次成像相机拍照。在此过程中,要尽量减少RNA胶接触紫外光,过度曝光会导致RNA信号降低。


在使用琼脂糖凝胶分离完整mRNA时,甲基氢氧化银虽然能有效且可逆地变性RNA,但其毒性需引起注意。因此,甲醛更常被选择作为替代变性剂。在整个实验操作中,务必避免RNase的污染,以保证实验结果的准确性。


扩展资料

Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。



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